Laboratorio 3: Big data e network tra fisica e biologia

Daniel Remondini, Enrico Giampieri, Claudia Sala

In piena era post-genomica, oggigiorno è possibile accedere a enormi banche dati pubbliche contenenti informazioni genetiche e genomiche, quali la sequenza del DNA di migliaia di organismi e milioni di misure relative all’attività cellulare di geni, proteine, composti chimici sotto molteplici perturbazioni (patologie, agenti chimici e fisici).

In questo panorama, il Laboratorio si propone di:

• fornire una panoramica su vari tipi di dati biologici high-throughput, descrivendo alcune delle principali questioni a cui si cerca di rispondere con essi;

• mostrare alcuni esempi pratici, descrivendo il ruolo delle metodologie fisiche e statistiche (“Big Data Analytics”, “Teoria dei Network”, “Processi Stocastici”) nel caratterizzare le proprietà di questi sistemi;

• fornire una chiave interpretativa alle analisi, inserendo i risultati in un contesto a network, e proponendo analogie con altre “strutture complesse” presenti nella vita di tutti i giorni, come il web e le reti sociali.

Il corso laboratorio favorirà lo sviluppo di svilupperà competenze trasversali nei seguenti ambiti: lavoro di gruppo, progettazione, comunicazione scientifica.

Il Laboratorio è adatto per studenti di IV e V, con una conoscenza di base dei principi di informatica (cicli, operazioni logiche), ed eventualmente del linguaggio Python.

Il corso sarà articolato in 2 lezioni frontali e 3 laboratori.

Tutte le lezioni avranno luogo presso il Dipartimento di Fisica e Astronomia di Bologna, Viale Berti Pichat 6/2.