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Laboratorio 5: Big data e network tra fisica e biologia

Responsabili: Daniel Remondini, Giampaolo Cristadoro, Enrico Giampieri

In piena era post-genomica, oggigiorno è possibile accedere a enormi banche dati pubbliche contenenti informazioni genetiche e genomiche, quali la sequenza del DNA di migliaia di organismi e milioni di misure relative all’attività cellulare di geni, proteine, composti chimici sotto molteplici perturbazioni (patologie, agenti chimici e fisici).

In questo panorama, il Laboratorio si propone di:

  • fornire una panoramica su vari tipi di dati biologici high-throughput, descrivendo alcune delle principali questioni a cui si cerca di rispondere con essi;

  • mostrare alcuni esempi pratici, descrivendo il ruolo delle metodologie fisiche e statistiche (“Big Data Analytics”, “Teoria dei Network”, “Processi Stocastici”) nel caratterizzare le proprietà di questi sistemi;

  • fornire una chiave interpretativa alle analisi, inserendo i risultati in un contesto a network, e proponendo analogie con altre “strutture complesse” presenti nella vita di tutti i giorni, come il web e le reti sociali.

 

Il Laboratorio è adatto per studenti con una conoscenza di base dei principi di informatica (cicli, operazioni logiche), ed eventualmente del linguaggio Python.

 

Il corso sarà articolato in 2 lezioni frontali e 3 laboratori.

 

Tutte le lezioni avranno luogo presso il Dipartimento di Fisica e Astronomia di Bologna, Viale Berti Pichat 6/2.

 

 

Calendario:

 

Incontro

Giorno

Ora

Aula

Tipologia Lezione

1

Mercoledì 18/01

14:30-17:30

Laboratorio di Fisica , Piano -1

Lezione

2

Mercoledì 25/01

14:30-17:30

Laboratorio di Fisica , Piano -1

Lezione

3

Mercoledì 1/02

14:30-18:30

Laboratorio di Fisica , Piano -1

Laboratorio

4

Mercoledì 8/02

14:30-18:30

Laboratorio di Fisica , Piano -1

Laboratorio

5

Mercoledì 15/02

14:30-18:30

Laboratorio di Fisica , Piano -1

Laboratorio

 

 

Materiale didattico

Contatti

difa.pls@unibo.it